Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HABP4Q5JVS0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HABP4Q5JVS0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms