Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms