Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A13Q5J8X5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms