Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CMPK2Q5EBM0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMPK2Q5EBM0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMPK2Q5EBM0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMPK2Q5EBM0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMPK2Q5EBM0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMPK2Q5EBM0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMPK2Q5EBM0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMPK2Q5EBM0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CMPK2Q5EBM0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMPK2Q5EBM0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMPK2Q5EBM0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMPK2Q5EBM0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMPK2Q5EBM0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMPK2Q5EBM0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMPK2Q5EBM0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMPK2Q5EBM0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMPK2Q5EBM0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms