Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF628Q5EBL2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF628Q5EBL2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms