Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC178Q5BJE1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms