Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A4Q53GD3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms