Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf22Q49AR2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf22Q49AR2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms