Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00303Q3SY05 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00303Q3SY05 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms