Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP13-4Q3LI77 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-4Q3LI77 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms