Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms