Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HLA-BQ31612 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLA-BQ31612 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-BQ31612 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-BQ31612 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-BQ31612 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms