Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM71Q2Q1W2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM71Q2Q1W2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms