Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSR1Q2NL82 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TSR1Q2NL82 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TSR1Q2NL82 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms