Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTC1Q2NKJ3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTC1Q2NKJ3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms