Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ISXQ2M1V0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms