Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
QSER1Q2KHR3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
QSER1Q2KHR3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
QSER1Q2KHR3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms