Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MICAQ29983 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MICAQ29983 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MICAQ29983 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MICAQ29983 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MICAQ29983 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MICAQ29983 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MICAQ29983 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MICAQ29983 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MICAQ29983 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MICAQ29983 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MICAQ29983 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MICAQ29983 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MICAQ29983 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MICAQ29983 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MICAQ29983 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MICAQ29983 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MICAQ29983 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MICAQ29983 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MICAQ29983 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MICAQ29983 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MICAQ29983 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MICAQ29983 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MICAQ29983 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MICAQ29983 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MICAQ29983 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MICAQ29983 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MICAQ29983 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MICAQ29983 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MICAQ29983 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MICAQ29983 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MICAQ29983 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MICAQ29983 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MICAQ29983 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MICAQ29983 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MICAQ29983 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MICAQ29983 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MICAQ29983 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MICAQ29983 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MICAQ29983 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MICAQ29983 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MICAQ29983 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MICAQ29983 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MICAQ29983 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MICAQ29983 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MICAQ29983 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MICAQ29983 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MICAQ29983 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MICAQ29983 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MICAQ29983 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MICAQ29983 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MICAQ29983 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MICAQ29983 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MICAQ29983 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MICAQ29983 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MICAQ29983 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MICAQ29983 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MICAQ29983 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MICAQ29983 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MICAQ29983 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MICAQ29983 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MICAQ29983 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MICAQ29983 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MICAQ29983 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MICAQ29983 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MICAQ29983 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MICAQ29983 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MICAQ29983 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MICAQ29983 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MICAQ29983 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MICAQ29983 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MICAQ29983 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MICAQ29983 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MICAQ29983 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MICAQ29983 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MICAQ29983 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MICAQ29983 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MICAQ29983 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MICAQ29983 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MICAQ29983 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MICAQ29983 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MICAQ29983 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MICAQ29983 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MICAQ29983 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MICAQ29983 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MICAQ29983 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MICAQ29983 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MICAQ29983 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MICAQ29983 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MICAQ29983 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MICAQ29983 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MICAQ29983 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MICAQ29983 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MICAQ29983 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MICAQ29983 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MICAQ29983 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MICAQ29983 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MICAQ29983 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MICAQ29983 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MICAQ29983 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms