Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SWI5Q1ZZU3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SWI5Q1ZZU3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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