Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNOP1Q1ED39 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNOP1Q1ED39 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNOP1Q1ED39 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms