Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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