Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STX1AQ16623 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STX1AQ16623 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms