Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK2Q16620 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK2Q16620 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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