Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NREPQ16612 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NREPQ16612 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NREPQ16612 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NREPQ16612 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NREPQ16612 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NREPQ16612 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NREPQ16612 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NREPQ16612 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NREPQ16612 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NREPQ16612 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NREPQ16612 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NREPQ16612 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NREPQ16612 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NREPQ16612 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NREPQ16612 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NREPQ16612 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NREPQ16612 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NREPQ16612 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NREPQ16612 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NREPQ16612 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NREPQ16612 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NREPQ16612 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NREPQ16612 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NREPQ16612 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NREPQ16612 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NREPQ16612 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NREPQ16612 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NREPQ16612 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NREPQ16612 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NREPQ16612 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NREPQ16612 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NREPQ16612 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NREPQ16612 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NREPQ16612 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NREPQ16612 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NREPQ16612 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NREPQ16612 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NREPQ16612 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NREPQ16612 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NREPQ16612 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NREPQ16612 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NREPQ16612 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NREPQ16612 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NREPQ16612 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NREPQ16612 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NREPQ16612 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NREPQ16612 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NREPQ16612 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NREPQ16612 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NREPQ16612 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NREPQ16612 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NREPQ16612 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NREPQ16612 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NREPQ16612 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NREPQ16612 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NREPQ16612 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms