Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECM1Q16610 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ECM1Q16610 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
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