Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SGCBQ16585 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
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SGCBQ16585 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SGCBQ16585 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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