Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CARTPTQ16568 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CARTPTQ16568 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms