Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSX2Q16385 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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