Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SSX1Q16384 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
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SSX1Q16384 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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SSX1Q16384 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSX1Q16384 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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