Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL1Q16048 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms