Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1EQ15878 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1EQ15878 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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