Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN9AQ15858 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN9AQ15858 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
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