Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNN3Q15417 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNN3Q15417 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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