Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR1Q15399 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TLR1Q15399 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TLR1Q15399 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TLR1Q15399 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TLR1Q15399 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TLR1Q15399 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLR1Q15399 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TLR1Q15399 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLR1Q15399 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TLR1Q15399 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLR1Q15399 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TLR1Q15399 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLR1Q15399 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLR1Q15399 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLR1Q15399 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TLR1Q15399 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TLR1Q15399 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TLR1Q15399 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLR1Q15399 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLR1Q15399 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLR1Q15399 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TLR1Q15399 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLR1Q15399 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TLR1Q15399 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TLR1Q15399 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TLR1Q15399 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLR1Q15399 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLR1Q15399 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TLR1Q15399 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLR1Q15399 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLR1Q15399 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLR1Q15399 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TLR1Q15399 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLR1Q15399 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLR1Q15399 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TLR1Q15399 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TLR1Q15399 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR1Q15399 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR1Q15399 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TLR1Q15399 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR1Q15399 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR1Q15399 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TLR1Q15399 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TLR1Q15399 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TLR1Q15399 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TLR1Q15399 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR1Q15399 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR1Q15399 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TLR1Q15399 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TLR1Q15399 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR1Q15399 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR1Q15399 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR1Q15399 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR1Q15399 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR1Q15399 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TLR1Q15399 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR1Q15399 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR1Q15399 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR1Q15399 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR1Q15399 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR1Q15399 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR1Q15399 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TLR1Q15399 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TLR1Q15399 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TLR1Q15399 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TLR1Q15399 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TLR1Q15399 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TLR1Q15399 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TLR1Q15399 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TLR1Q15399 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TLR1Q15399 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TLR1Q15399 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TLR1Q15399 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms