Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
HERPUD1Q15011 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERPUD1Q15011 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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