Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SHPRHQ149N8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
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