Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NR1I3Q14994 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NR1I3Q14994 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NR1I3Q14994 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR1I3Q14994 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR1I3Q14994 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR1I3Q14994 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR1I3Q14994 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR1I3Q14994 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR1I3Q14994 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR1I3Q14994 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR1I3Q14994 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR1I3Q14994 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR1I3Q14994 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms