Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMC1AQ14683 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC1AQ14683 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
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