Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CUL4BQ13620 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
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