Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LSAMPQ13449 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LSAMPQ13449 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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