Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MSLNQ13421 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms