Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP140Q13342 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP140Q13342 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP140Q13342 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP140Q13342 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP140Q13342 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SP140Q13342 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP140Q13342 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP140Q13342 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP140Q13342 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP140Q13342 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP140Q13342 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP140Q13342 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP140Q13342 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP140Q13342 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP140Q13342 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP140Q13342 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP140Q13342 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP140Q13342 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP140Q13342 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP140Q13342 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP140Q13342 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP140Q13342 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP140Q13342 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP140Q13342 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP140Q13342 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP140Q13342 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP140Q13342 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP140Q13342 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP140Q13342 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP140Q13342 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP140Q13342 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP140Q13342 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP140Q13342 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SP140Q13342 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP140Q13342 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SP140Q13342 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP140Q13342 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP140Q13342 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP140Q13342 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
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SP140Q13342 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SP140Q13342 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SP140Q13342 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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SP140Q13342 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SP140Q13342 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SP140Q13342 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SP140Q13342 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SP140Q13342 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SP140Q13342 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SP140Q13342 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SP140Q13342 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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SP140Q13342 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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SP140Q13342 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SP140Q13342 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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SP140Q13342 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SP140Q13342 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SP140Q13342 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SP140Q13342 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SP140Q13342 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SP140Q13342 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SP140Q13342 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SP140Q13342 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SP140Q13342 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SP140Q13342 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SP140Q13342 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SP140Q13342 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SP140Q13342 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SP140Q13342 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SP140Q13342 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP140Q13342 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SP140Q13342 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP140Q13342 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP140Q13342 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SP140Q13342 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP140Q13342 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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