Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SCGB2A2Q13296 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCGB2A2Q13296 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms