Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR5A1Q13285 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR5A1Q13285 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms