Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPA4Q13156 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPA4Q13156 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPA4Q13156 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPA4Q13156 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPA4Q13156 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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