Protein–RNA interactions for Protein: Q13103

SPP2, Secreted phosphoprotein 24, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP2Q13103 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPP2Q13103 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPP2Q13103 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPP2Q13103 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPP2Q13103 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPP2Q13103 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPP2Q13103 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPP2Q13103 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPP2Q13103 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPP2Q13103 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPP2Q13103 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPP2Q13103 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPP2Q13103 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPP2Q13103 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPP2Q13103 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms