Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BNIP1Q12981 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP1Q12981 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP1Q12981 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP1Q12981 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP1Q12981 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP1Q12981 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP1Q12981 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP1Q12981 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP1Q12981 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP1Q12981 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP1Q12981 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP1Q12981 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP1Q12981 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP1Q12981 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP1Q12981 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP1Q12981 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP1Q12981 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNIP1Q12981 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP1Q12981 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP1Q12981 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP1Q12981 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP1Q12981 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP1Q12981 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP1Q12981 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP1Q12981 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP1Q12981 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP1Q12981 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP1Q12981 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP1Q12981 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP1Q12981 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP1Q12981 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BNIP1Q12981 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP1Q12981 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP1Q12981 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP1Q12981 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP1Q12981 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP1Q12981 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP1Q12981 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP1Q12981 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP1Q12981 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP1Q12981 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP1Q12981 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP1Q12981 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNIP1Q12981 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP1Q12981 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP1Q12981 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP1Q12981 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP1Q12981 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP1Q12981 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP1Q12981 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP1Q12981 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BNIP1Q12981 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP1Q12981 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP1Q12981 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP1Q12981 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP1Q12981 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP1Q12981 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP1Q12981 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP1Q12981 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP1Q12981 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP1Q12981 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP1Q12981 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP1Q12981 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP1Q12981 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP1Q12981 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP1Q12981 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP1Q12981 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP1Q12981 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP1Q12981 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP1Q12981 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP1Q12981 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP1Q12981 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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