Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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FOXD4Q12950 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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FOXD4Q12950 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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FOXD4Q12950 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4Q12950 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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