Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWF1Q12792 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms