Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPAL4Q0D2K0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPAL4Q0D2K0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms